Genel fotosentez denklemi aşağıdaki gibidir:
nCO2 + 2nH2O + Işık enerjisi →(sugüneş:fotosentez) (CH2O)n + nO2 + nH2O Ancak heksoz şekerleri ve nişasta ana ürünler olduğundan, genelde aşağıdaki spesifik (basit) denklem fotosentezin ifadesinde kullanılır:
6CO2 + 12H2O + Işık enerjisi → C6H12O6 + 6O2 + 6H2O + 673 Kalori
Burada C, CO2’den ve H, H2O’dan gelmektedir
Yukarıdaki denklemde görüldüğü üzere basit karbonhidratların yapısına katılan O2’nin sudan mı yoksa karbondioksitten mi geldiği sorusu önem taşımaktadır Bu konuya radyoaktif ağır su ile yapılan denemelerle açıklık getirmiştir
Radyoaktif olarak işaretlenmiş 0218 ile fotosentez sonucu açığa çıkan O2’nin sudan geldiği bulunmuştur Karbonhidratların yapısına katılan O ise, karbondioksitten olmaktadırFotosentez sırasıyla aydınlık ve karanlık safha olmak üzere 2 kısımda gerçekleşirAydınlık safha için ışık gereklidirKaranlık safhada ise ışık kullanılmazFakat karanlık safhada aydınlık safhanın ürünleri kullanıldığı için aydınlık safha olmadan karanlık safha gerçekleşemezAyrıca bakterilerde H kaynağı olarak H2O kullanılmadığı için ürün olarak O2 açığa çıkmaz